토마토 재배에는 해충으로부터 식물을 보호하는 것이 포함됩니다. 그중에서도 가장 골치 아픈 해충은 총채벌레입니다.
콜로라도 감자잎벌레는 어린 감자에 피해를 줍니다. 또한 토마토, 피망, 가지의 잎도 먹습니다.
흰가루병은 곰팡이에 의해 발생하는 감염성 질병입니다. 흰가루병의 흔적은 식물뿐만 아니라 다양한 곳에서 발견될 수 있습니다.
클라도스포리오시스는 토마토 식물과 열매에 영향을 미치는 위험한 곰팡이 감염병입니다. 이 질병은 매우 위험합니다.
거의 모든 채소 작물의 묘목은 줄기가 검게 변하는 병에 취약합니다. 이 병을 뿌리목썩음병이라고 합니다.
역병은 가지과 식물을 매우 좋아하기 때문에 토마토에서 이 곰팡이를 완전히 제거하기는 어렵습니다.